Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms