Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms