Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFNP31947 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFNP31947 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFNP31947 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFNP31947 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFNP31947 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFNP31947 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFNP31947 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFNP31947 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFNP31947 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFNP31947 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFNP31947 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFNP31947 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFNP31947 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFNP31947 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFNP31947 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFNP31947 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms