Protein–RNA interactions for Protein: P30838

ALDH3A1, Aldehyde dehydrogenase, dimeric NADP-preferring, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH3A1P30838 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH3A1P30838 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms