Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms