Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID4AP29374 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms