Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABRB3P28472 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRB3P28472 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms