Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA3P25788 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms