Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms