Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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TNNI3P19429 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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TNNI3P19429 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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TNNI3P19429 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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TNNI3P19429 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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