Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

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Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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