Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms