Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMP3P12645 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMP3P12645 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMP3P12645 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms