Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MTHFD1P11586 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MTHFD1P11586 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MTHFD1P11586 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MTHFD1P11586 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MTHFD1P11586 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MTHFD1P11586 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFD1P11586 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD1P11586 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms