Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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