Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RARAP10276 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARAP10276 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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