Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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