Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC172P0C7W6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms