Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM58BPP0C7Q3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM58BPP0C7Q3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM58BPP0C7Q3 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM58BPP0C7Q3 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM58BPP0C7Q3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms