Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms