Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

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Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
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