Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP104O60308 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP104O60308 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms