Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CREB3O43889 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CREB3O43889 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CREB3O43889 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms