Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR3AO14802 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR3AO14802 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR3AO14802 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR3AO14802 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR3AO14802 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR3AO14802 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR3AO14802 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR3AO14802 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR3AO14802 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR3AO14802 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR3AO14802 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR3AO14802 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR3AO14802 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR3AO14802 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR3AO14802 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR3AO14802 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR3AO14802 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR3AO14802 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms