Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms