Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms