Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms