Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SNX6Q9UNH7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SNX6Q9UNH7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SNX6Q9UNH7 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SNX6Q9UNH7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SNX6Q9UNH7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SNX6Q9UNH7 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SNX6Q9UNH7 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SNX6Q9UNH7 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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