Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTH4Q9UIA0 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms