Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms