Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFIP11Q9UBB9 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms