Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms