Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIN1Q9NXP7 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms