Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms