Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ASCL3Q9NQ33 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms