Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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