Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRHQ9HD43 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms