Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms