Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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FOXQ1Q9C009 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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FOXQ1Q9C009 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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FOXQ1Q9C009 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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FOXQ1Q9C009 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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FOXQ1Q9C009 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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FOXQ1Q9C009 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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FOXQ1Q9C009 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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FOXQ1Q9C009 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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FOXQ1Q9C009 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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FOXQ1Q9C009 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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