Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 DLGAP2-214ENST00000612087 10088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms