Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms