Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms