Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms