Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms