Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms