Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MESP1Q9BRJ9 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms