Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQN1

FAM83C, Protein FAM83C, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83CQ9BQN1 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
FAM83CQ9BQN1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM83CQ9BQN1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM83CQ9BQN1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM83CQ9BQN1 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM83CQ9BQN1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM83CQ9BQN1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM83CQ9BQN1 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms