Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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SPOCK3Q9BQ16 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SPOCK3Q9BQ16 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SPOCK3Q9BQ16 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SPOCK3Q9BQ16 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SPOCK3Q9BQ16 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SPOCK3Q9BQ16 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SPOCK3Q9BQ16 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SPOCK3Q9BQ16 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SPOCK3Q9BQ16 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SPOCK3Q9BQ16 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SPOCK3Q9BQ16 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SPOCK3Q9BQ16 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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