Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms