Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms